SILAC代謝標記定量實驗服務
實驗技術簡介: SIL AC的基本原理是分別用天然同位素(輕型)或穩(wěn)定同位素(重型)標記的必需氨基酸取代細胞培養(yǎng)基中相應氨基酸，細胞經(jīng)5-6個倍增周期后，穩(wěn)定同位素標記的氨基酸*摻入到細胞新合成的蛋白質中替代了原有氨基酸。不同標記細胞的裂解蛋白按細胞數(shù)或蛋白量等比例混合，經(jīng)分離、純化后進行質譜鑒定，根據(jù)一級質譜圖中兩個同位 素型肽段的面積比較進行相對定量。屬于體內(nèi)代謝標記法。
實驗操作流程:
1、蛋白提取和樣品制備
2、標記效率測試
3、樣品混臺
4、SDS-PAGE分級
5、酶解
6、質譜鑒定
7、軟件分析
8、定性定量蛋白質組結果
9、生物信息學數(shù)據(jù)挖掘和統(tǒng)計分析
實驗注意事項:
客戶提供:
1、蛋白質提取物: 濃度>1μg/ul, 蛋白質總量>300μg.
2、細胞:通過細胞計數(shù)取不少于2x106個細胞于EP管，加入0 5ml生理鹽水或蛋白保護劑，混勻后保存于冰箱(-80°C， 避免反復凍融)。
交付標準:
1、蛋白質鑒定和SIL AC定量分析結果;
2、客戶蛋白質對應的質譜峰圖;
3、SIL AC實驗完整的實驗步驟、使用儀器、軟件檢索參數(shù)等。
其他:
1、SILAC是體內(nèi)標記技術，穩(wěn)定同位素標記的氨基酸與天然氨基酸化學性質基本相同，所標記的細胞和未標記細胞在生物學行為上幾乎沒有差異，標記效率可高達100%。
2、采用質譜定量,定量結果準確且批次變異小、重復性好。
3、體內(nèi)代謝標記與SDS- PAGE或色譜分離技術相結合，兼容疏水性蛋白和偏堿性蛋白，不受蛋白性質限制。
4、多個樣品混合后同時進行分離、酶切和鑒定,后續(xù)實驗對樣品的影響一致， 減少了實驗操作和儀器設備產(chǎn)生的影響。
5、由于該技術屬于體內(nèi)標記，標記效果穩(wěn)定，其標記效率不受裂解液的影響，不僅適合于進行全細胞蛋白的分析，還適合于膜蛋白的鑒定和定量。
6、與化學標記相比，SIL AC方法蛋白需要量明顯減少，通常每個樣品只需要幾十微克的蛋白量。
7、活體標記，更接近樣品真實狀態(tài)。
8、只適用于活體培養(yǎng)的細胞，對于生物醫(yī)學研究中常用的組織樣品，體液樣品等無法分析,對于動物模型的標記成本太大，無法實現(xiàn)。與體外標記技術相比，SIL AC屬于體內(nèi)標記，具有以下技術優(yōu)勢
1、高通量，可同時鑒定并定量數(shù)百至數(shù)千種蛋白質;
2、定量精確，降低由于樣品制備不同而造成的實驗差異;
3、線性定量范圍廣;
4、靈敏度更高，蛋白質需要量明顯減少;
5、標記采用的是體內(nèi)標記技術，更接近樣品真實狀態(tài)。
SILAC技術服務內(nèi)容
1、細胞同位素標記;
3、SDS-PAGE分離;
4、胰酶酶切后液相分離和質譜分析;
5、數(shù)據(jù)庫檢索及蛋白質定量分析;
6、差異蛋白的生物信息學分析;
7、實驗報告提交。
實驗服務報告內(nèi)容
1、蛋白定鑒定和SIL AC定量分析結果;
2、顧客蛋白質對應的質譜峰圖;
3、SIL AC實驗完整的實驗步驟、使用儀器、軟件檢索參數(shù)等。
技術服務優(yōu)勢
1、靈敏度高，檢測限低，可檢測出低豐度蛋白;
2、分離能力強，分析范圍廣，iITRAQ可以對任何類型的蛋白質進行分離鑒定，包括高分子量蛋白質、酸性蛋白和堿性蛋白，膜蛋白和不溶性蛋白;
3、高通量:同時對8個樣本進行分析，提高了實驗通量，可同時對多個時間點或不同處理的蛋白質進行分析;
4、結果可靠:定性與定量分析結果更加可靠;
5、自動化程度高:液相與質譜連用，自動化操作，分析速度快，分離效果好。
實驗代做服務：
ELISA試劑盒免費代檢測 | CCK8檢測 | 基因組DNA提取
| 蛋白相互作用分析 |
Western Blot
| 免疫組化 | 熒光定量PCR | 動物模型服務 |
流式細胞檢測 | 細胞增殖 | 激光共聚焦 | DNA甲基化實驗 |
細胞劃痕 | 鈣離子濃度檢測 | 掃描電鏡實驗 | microRNA 測序 |
動物實驗 | Taqman探針 | ATP/ADP檢測
| 石蠟/冰凍切片 |
定點突變 | 線粒體膜電位(MMP)檢測 | 細胞生長曲線的測定 | 藥理毒理動物實驗
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免疫共沉淀 | 真核表達載體構建 | 染色質免疫沉淀CHIP | 非標定量（Label-free）實驗 |
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